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3월 회의록 대응 현황 (제2차 AI-RI 과학자 회의)

회의 일자: 2026-03-09  |  문서 번호: KAERI-AIRL-MOM-2026-002  |  대응 작성일: 2026-06-23

원칙: 환각 0 · 누락 0 — 모든 "구현 완료" 주장은 file:line 근거 직접 확인. 근거 없으면 미대응 또는 [미확인] 명시.

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두괄식 요약

항목	내용
안건 총 수	11건 (A-01~A-10 + 안건 1~11)
완전 구현(코드 근거 확인)	안건 6·8·10 핵심 메트릭 다수
자체 대체 (외부 도구 → in-house)	A-01(Serum), A-02(ADMET) — 회의록 권고 도구 0종 직접 통합, HIGH-BLOCKER 근거로 자체 구현 전환
미대응 고우선도 GAP	RCP Stability 모듈, γ-Glu-ADO₂ 링커, BLOSUM Tier 2/3 병렬 레인, 컨센서스 스크리닝 로직
신뢰등급 정책	반감기·ADMET 예측값 = 상대 순위 참고 전용. 임상 절대값 인용 금지. 모든 모듈에 H-06 가드 부착.

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A-01 대응 (PepCalc / PeptideCutter → Step 8 통합)

원문: "PepCalc/PeptideCutter를 AI 파이프라인 Step 8에 통합하고 SST-14 변형체 혈청 t1/2 예측값 산출"

결론: 미통합 → 자체 대체 완료. D-아미노산 HIGH-BLOCKER(조사 7종 모두 D-aa 미지원) 확인 후 자체 앙상블로 전환.

구성요소	파일	핵심 라인	역할
휴리스틱 반감기 모델	AG_src/pipeline/step08_stability.py	:193 predict_half_life()	D-aa·아실화·PEG화·고리화 지원
프로테아제 취약성 테이블	동일	:64 _PROTEASE_VULNERABILITY	PeptideCutter 대체 — 트립신·키모트립신·엘라스타제 in-house
Modification 제안	동일	:315 suggest_modifications()	C18/PEG화/D-AA 우선순위 제안
RF 자체 학습 모델	pyrosetta_flow/halflife_model/halflife_gbr.joblib	—	PEPlife2 학습, CV Spearman 0.784
앙상블 결합	pyrosetta_flow/halflife_ensemble.py	:81–108 ensemble_halflife()	휴리스틱+RF log10 평균. RF 미가용 시 fallback
Silo B 통합	pyrosetta_flow/multiobjective.py	:115–121	ensemble_halflife() 호출 → half_life_h 산출
안정성 게이트	AG_src/pipeline/step08_stability.py	:540–562 apply_stability_gate()	relative_percentile 모드 실재

벤치마크 검증 (_workspace/report_site/_analysis/14_benchmark_validation.md):

지표	수치	조건
전체 raw Spearman ρ	+0.396	32종 유효, 변형 정보 없이 서열만
전체 +metadata Spearman ρ	+0.662	변형 플래그 주입 시 (버킷팅 효과 — 모델 고유 실력 아님)
RF 모델 CV Spearman	0.784	in-domain (PEPlife2 serum/plasma)

신뢰등급: 상대순위 [MED] / 절대값 [LOW]. +metadata ρ는 fatty_acid×2800 배수 수동 주입 효과. 임상 t½ 절대값 직접 인용 금지.

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A-02 대응 (ADMETlab 3.0 → ADMET 프로파일)

원문: "ADMETlab 3.0 API 활용, 상위 21개 후보 ADMET 프로파일 일괄 생성"

결론: 서버 장애로 미평가 → pepADMET 로컬 대체. ADMETlab 3.0 HTTP 404/500 확인 (pharmacology_guards.py:418-430 HEURISTIC 가드 등록).

도구	우리 대응 상태	비고
ADMETlab 3.0	미적용 (fail-closed)	API 서버 장애(TLS 만료·MW<500 제한)
pepADMET 로컬 MLR-GAT	대체 운용 중	D-aa AUC 0.677 (양의 변별), L-aa AUC 0.146 (역변별 — 구조적 한계)
H-06 가드	전 모듈 부착	recommended_for_decision=False

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안건 1~11 대응 요약표

안건 1 — Serum Stability 도구 7종

순위	도구	우리 대응	근거
1	PepCalc / Peptide2.0	자체 대체	step08_stability.py:1-49, halflife_ensemble.py:1-10
2	PepLife2 (IIITD)	자체 학습 GBR 대체	halflife_model/halflife_gbr.joblib
3	DPPred + PeptideCutter	자체 대체	step08_stability.py:64-103 (테이블), :278-291
4	PepAnalyzer	미대응	[미확인]
5	Stability / MahLooL BiRNN	미대응	[미확인]
6	ADMETlab 3.0 (HLM/RLM)	미대응 (A-02 범주)	[미확인 in step08 범위]
7	SwissADME	미대응 (자체 pharmacology 별도)	[미확인]

안건 2 — ADMET 도구 6종

순위	도구	우리 대응	근거
1	ADMETlab 3.0	미적용 (fail-closed)	pharmacology_guards.py:418-430
2	Deep-PK (Oxford 2024)	미대응	[미확인]
3	pkCSM	미대응 (MW>600 Da 제한 위반)	[미확인]
4	admetSAR 2.0	미대응	[미확인]
5	ProTox-3.0	미대응 (부분 보완)	pharmacology_guards.py 신독성 Risk Score
보조	SwissADME	간접 대응 (자체 descriptor r≈1.0)	pharma_properties.py:285-351

안건 3 — C18/PEG화 링커

항목	상태	근거
Lys ε-NH₂ C18 부착 위치	구현됨	step08_stability.py:318-331
C16/C18 알부민 배수 모델링	구현됨	step08_stability.py:116 log10(2800.0)
PEG 위치 (N-말단/Lys)	구현됨	step08_stability.py:339-354
γ-Glu-ADO₂ 링커 구조	미대응	step08 전체에 γ-Glu/ADO₂ 없음
C10~C18 chain-length 계열	미대응	C18 단일값만
FWKT 거리 제약 (≥4~5 잔기)	미대응	단순 첫 Lys 사용
Lys 단일 acylation 충돌 규칙	구현됨	pharmacology_guards.py:115-128 C-01 규칙

안건 4 — BLOSUM62 Tiered 전략

항목	상태	근거
Tier 1: BLOSUM62 ≥ 0 보존 치환	구현됨	step03b_blosum_mutation.py:1-30
소수성 제약 필터	구현됨	step03b_blosum_mutation.py:hydrophobicity_check
Tier 2: 소수성 ±3 + 전하 ±1 레인	미대응	독립 레인 없음
Tier 3: D-AA/Aib/β-AA 자유 탐색	미대응	AMINO_ACIDS 표준 20종만 (line:58)
Thompson Sampling 레인별 자원 배분	부분구현	pyrosetta_flow/bandit.py, 3-tier 라우팅 [미확인]

안건 5 — GLP-1 개발 모델 적용

항목	상태	근거
GLP-1 기반 반감기 모델	구현됨	step08_stability.py:4-11 (헤더 명시)
C18 알부민 배수 파라미터	구현됨	step08_stability.py:98,116
SSTR2↔GLP-1R 차이 인식	구현됨(주석)	step08_stability.py:17
GLP-1R 멀티타겟 확장 모듈	미대응	로드맵 미착수

안건 6 — Critic 성공 후보 5클러스터 (A결합엘리트~E탐색)

클러스터	조건	상태	근거
A: ddG ≤ −8.0 + clash ≤ 5 + pLDDT ≥ 75 + FWKT 접촉	최우선 합성	구현됨	cluster_report.py:160-
B: selectivity_margin ≥ 3.0	SSTR2 선택성	구현됨	cluster_report.py:287-299
C: Instability < 30 + protease ≤ 8	안정성 우선	구현됨	cluster_report.py:300-312
D: GRAVY −1.0~+0.5 + n_strong ≥ 1	방사화학 친화	구현됨	cluster_report.py:230-
E: 나머지	Novel Scaffold	구현됨	cluster_report.py:325-327
batch_classify API	distribution 반환	구현됨	cluster_report.py:341-381
A>B>C>D>E 우선순위	중복 배정 시 최고	구현됨	cluster_report.py:24-25
Critic Agent 직접 연동	Orchestrator 배치	부분구현	critic.py cluster 직접 호출 [미확인]

안건 7 — ΔG-구조 관계

항목	상태	근거
clash ≤ 10 AND ddG ≤ −5.0 이중 Gate	구현됨	multiobjective.py:494-501
도킹 스코어 vs ΔΔG 분리 수집	구현됨	runner.py FlexPepDock 분리 처리
OpenMM MD → ΔG 보정	미대응	OpenMM 호출 없음

안건 8 — SSTR1/3/4/5 교차 스크리닝

항목	상태	근거
step05b_selectivity.py	구현됨	AG_src/pipeline/step05b_selectivity.py:1-32
SSTR1/3/4/5 PDB 경로	구현됨	multiobjective.py:501-504
selectivity_margin 공식	구현됨	step05b_selectivity.py:13
SelectivityLeaderboard	구현됨	pyrosetta_flow/selectivity_loop.py
home-advantage 기준선	구현됨	multiobjective.py:510-527
마진 임계값 ≥ +3 kcal/mol	부분구현	기본값 10.0 (회의록 권고 +3과 불일치)
네거티브 디자인 피드백 루프	부분구현	selectivity_loop 리더보드 갱신만 확인

안건 9 — PeptiVerse 6특성·2단계 스크리닝

특성	상태	근거
Solubility	미대응	명시적 gate 없음
Hemolysis	구현됨	pepadmet_toxicity.py:26, multiobjective.py:212-220
Toxicity	구현됨	backend/admet.py:150-225
Permeability	미대응	permeability 예측 모듈 없음
Binding Affinity	구현됨	multiobjective.py + runner.py Gate
Half-life	구현됨	step08_stability.py:201-, halflife_ensemble.py
RCY ≥ 95% 게이트	미대응	pharmacology.py 전체에 rcy/RCP 없음
컨센서스 3도구 이상 통과	미대응	앙상블과 별개 로직 없음

안건 10 — 13-메트릭 패널

등급	메트릭	상태	근거
★★★★★	GRAVY	구현됨	backend/pharmacology.py:112-119
★★★★★	신독성 Risk Score	구현됨	backend/admet.py:150-225
★★★★★	Protease Cleavage Sites	구현됨	backend/pharmacology.py:379-426
★★★★☆	Instability Index	구현됨	backend/pharmacology.py:138-147
★★★★☆	Aliphatic Index	구현됨	backend/pharmacology.py:149-165
★★★★☆	Boman Index	구현됨	backend/pharmacology.py:124-133
★★★☆☆	pI (SS bond 보정)	구현됨	backend/pharmacology.py:167-193
★★★☆☆	Metal Coordination Score	구현됨	backend/pharmacology.py:484-507
★★★☆☆	Wimley-White Scale	구현됨	backend/pharmacology.py:316-338
★★☆☆☆	N-end Rule	구현됨	backend/pharmacology.py:250-273
★★☆☆☆	pH-dependent Charge	구현됨	backend/pharmacology.py:340-377
★★☆☆☆	Hydrophobic Moment	구현됨	backend/pharmacology.py:275-314
★☆☆☆☆	ε280	구현됨	backend/pharmacology.py:224-247
추가	Radiolysis Susceptibility	구현됨	backend/pharmacology.py:509-530, tests/test_radiolysis.py
추가	Chelator-Binding Compatibility	부분구현	pharma_properties.py:674-678 (N-말단만)
추가	Selectivity Margin Index	구현됨	multiobjective.py:528-612
추가	RCP Stability Prediction	미대응	pharmacology.py 전체에 RCP 없음

안건 11 — DOTA/DFO 킬레이터

항목	상태	근거
DOTA N-말단 킬레이터 호환성	구현됨	pharma_properties.py:674-678
Metal Coordination (경쟁 배위)	구현됨	backend/pharmacology.py:484-507
DOTA vs DFO 킬레이터 선택 모듈	미대응	[미확인]
NOTA/DOTAGA/DATA5m 지원	미대응	관련 코드 없음
표지 RCY/RCP 예측	미대응	[미확인]
On-resin 컨주게이션 위치 최적화	미대응	pos1/13 자동 평가 코드 없음

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A-03~A-10 액션아이템 이행 상태

A-item	원문	담당	상태	근거
A-01	PepCalc/PeptideCutter Step 8 통합	AI팀	자체 대체	step08_stability.py:193, halflife_ensemble.py
A-02	ADMETlab 3.0 상위 21개 프로파일	AI팀	자체 대체	pepadmet_toxicity.py, pepadmet_runner.py
A-03	SSTR1/3/4/5 AlphaFold + 도킹 파이프라인	AI팀	구현 완료(방법 변경)	AutoDock→Rosetta. step05b_selectivity.py, offtarget_dock.py
A-04	Critic Agent ClusterReport(A~E) 추가	AI팀	ClusterReport 완료	cluster_report.py:24(Priority), 339(batch_classify)
A-05	BLOSUM Tier 1/2/3 병렬 레인 Step 3B 재설계	AI팀	Tier 1만 구현	step03b_blosum_mutation.py (표준 20종 AA)
A-06	Peptron·HLB PEP·Anygen 합성 견적 문의	RI팀	AI팀 업무 범위 외	—
A-07	SST-14 상위 3개 C18 변형체 설계 후 AI팀 검토	RI팀	AI팀 업무 범위 외	—
A-08	13-메트릭에 Selectivity/Radiolysis/Chelator 추가	AI팀	구현 완료	pharma_properties.py:686(radiolysis), selectivity_loop.py
A-09	JCIM 논문(김민규 교수팀) 검토 + 적용 가능 항목	AI팀+RI팀	부분 대응	방법론 적용 논의 기록. 정식 보고서 [미확인]
A-10	RCP 안정성 예측 모듈 구현	AI팀	미대응	backend/pharmacology.py 전체에 RCP 없음 확인

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종합 갭 요약

안건	구현/전체	핵심 미결 GAP
안건 1 (Serum 도구 7종)	3/7	PepCalc/PeptideCutter 직접 통합 (HIGH-BLOCKER로 자체 대체)
안건 2 (ADMET 도구 6종)	0/6 직접	ADMETlab 3.0 서버 장애. pepADMET 대체 (L-aa 역변별 실측)
안건 3 (C18/PEG)	4/8	γ-Glu-ADO₂ 링커, C10~C18 계열, FWKT 거리 필터
안건 4 (BLOSUM Tier)	2/5	Tier 2/3 병렬 레인, D-AA/Aib/β-AA 탐색 레인
안건 5 (GLP-1)	3/4	GLP-1R 별도 모듈 (로드맵 미착수)
안건 6 (5클러스터)	7/9	Critic 직접 연동, 실패→로그 전환 확인 필요
안건 7 (ΔG-구조)	3/4	OpenMM MD 기반 ΔG 보정
안건 8 (SSTR 선택성)	5/7	네거티브 디자인 피드백, AlphaFold 출처 확인
안건 9 (PeptiVerse 2단계)	6/10	RCY 게이트, 컨센서스 로직, PeptiVerse 직접 통합
안건 10 (13-메트릭)	14/17	RCP Stability, Chelator 전체 계산
안건 11 (DOTA/합성업체)	2/7	킬레이터 선택 모듈, RCP, pos1/13 자동 평가

최고 우선도 미대응 항목

순위	항목	관련 안건/액션
1	RCP Stability Prediction 모듈	안건 9·10·11 / A-10
2	γ-Glu-ADO₂ 링커 구조 반감기 모델	안건 3
3	BLOSUM Tier 2/3 병렬 레인 (D-AA/Aib/β-AA)	안건 4 / A-05
4	컨센서스 스크리닝 로직 (3도구 이상 통과)	안건 9
5	OpenMM MD → ΔG 보정	안건 7

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신뢰등급 정책

모듈	신뢰등급	비고
반감기 예측 (raw, 서열만)	상대순위 [MED] / 절대값 [LOW]	벤치 raw ρ=+0.396. 임상 t½ 절대값 인용 금지
반감기 예측 (+metadata)	상대순위 [MED] / 절대값 [참고 전용]	변형 배수 수동 주입 버킷팅 효과 — 모델 고유 실력 아님
pepADMET L-aa HC50	[LOW] — 역변별 실측 (AUC 0.146)	D-aa는 AUC 0.677 (양의 변별)
물성 descriptor 5종	[HIGH] — r≈1.0000	결정론적 공식
선택성 마진	[MED] — 상대 순위 유효	절대 ΔddG 임상 의미 한계
RCY/RCP	미구현 — 예측값 없음	어떤 수치도 생성하지 않음

작성 근거: _workspace/meetlog_resp/RESPONSE_MARCH.md (engineer-backend, 2026-06-23). 모든 "구현됨" 주장은 file:line으로 직접 확인 가능.