기능 상세 보고
08. 시뮬레이션 결과 종합표
핵심 결론 (두괄식) - 누적 도킹 20,733건(유효 20,656 / 고유 서열 3,014종)을 단일 테이블로 종합.
실측HIGH(FlexPepDock PyRosetta 실행 산물) [데이터: [LOCAL_PATH]] - 4지표 완비(ddG·선택성Δmargin·hc50·반감기) 서열 = leaderboard 50건. 나머지 20,683건은 ddG만 보유 → 결측은 결측으로 표기(추정 금지). - best =AGCKNFFWKTDTSC(F11D): Δmargin +10.5351, ddG -45.11 kcal/mol(native 대비 ΔΔG -3.12), 비독성. 선택성 핵심 = pos11 변이 [데이터: .../runs/pyrosetta_flow/global_selectivity_leaderboard.json] - 무한엔진 가동 중(epochs_done=125, running=true, passing_count=48) — 본 표는 2026-06-19 스냅샷이며 수치는 갱신될 수 있음 [데이터: .../runs/pyrosetta_flow/discovery_status.json]. - 신뢰등급 혼재: ddG·Δmargin =실측HIGH, hc50·반감기 =surrogate-상대MED(절대값 미검증, 상대순위 전용). 반감기는 raw=headline(고유 실력), meta(변형 버킷팅)는 동급 비교 금지.지표 정의 (한 줄) - ddG = FlexPepDock 결합 자유에너지(낮을수록 강한 결합). ΔΔG vs native = 후보 ddG − native(-41.99). 음수 = native보다 강함. - Δmargin (선택성) = SSTR2 우위(home-advantage) 마진의 native 대비 증가분. 양수 = SSTR2 선택성 개선. - hc50_vs_native = pepADMET 용혈 농도 surrogate의 native 대비 차(양수 = 덜 독성).
surrogate-상대MED. - surrogate_halflife = heuristic+RF 앙상블 혈청 반감기(h). raw=고유 실력.surrogate-상대MED.
1. 전체 시뮬레이션 ddg 분포 (20,733건)
원시 기록 경로:
runs/pyrosetta_flow/experiment_log.jsonl[데이터: [LOCAL_PATH]]
| 항목 | 값 |
|---|---|
| 총 레코드 | 20,733건 |
| 유효(success + |ddg|<900) | 20,656건 |
| 실패/오류 | 77건 |
| 고유 서열 수 | 3,014종 |
| 선택됨(selected=true) | 7,037건 / 고유 2,025종 |
| ddg 최솟값 | -624.60 kcal/mol |
| ddg 최댓값 | 898.02 kcal/mol |
| ddg 평균 | 23.95 kcal/mol |
| ddg 중앙값 | -4.13 kcal/mol |
| ddg 표준편차 | 96.34 kcal/mol |
| ddg 25% 백분위 | -21.26 kcal/mol |
| ddg 75% 백분위 | 22.23 kcal/mol |
| ddg 5% 백분위 | -36.56 kcal/mol |
| ddg 95% 백분위 | 314.08 kcal/mol |
| native(AGCKNFFWKTFTSC) ddg 기준선 | -41.9864 kcal/mol (n=2) |
| leaderboard 누적 ingest(전체) | 749건 |
| leaderboard 스크리닝 고유 서열 | 715종 |
| leaderboard 등재 고유 서열 | 50종 (capacity 50) |
신뢰등급: 실측HIGH — FlexPepDock PyRosetta 실행 산물 [근거: [LOCAL_PATH]]
2. 완비 지표 커버리지
원시 기록 경로:
runs/pyrosetta_flow/global_selectivity_leaderboard.json[데이터: [LOCAL_PATH]]
| 지표 | 커버리지 | 신뢰등급 | 비고 |
|---|---|---|---|
| ddg (결합에너지) | 20,656건 유효 / 20733건 전체 | 실측HIGH | FlexPepDock 실측 |
| selectivity Δmargin | 50건 | 실측HIGH | leaderboard 한정; FlexPepDock 기반 |
| hc50 (독성) | 50건 | surrogate-상대MED | pepADMET 모델; 절대단위 미검증, 상대비교 전용 |
| surrogate_halflife | 51건 | surrogate-상대MED | heuristic+RF 앙상블; raw=고유실력, 절대값 미검증 |
| 4지표 완비 | 50건 | — | leaderboard 서열 한정 |
주의: experiment_log 20,733건에는 halflife/hc50 없음 — 결측 표기(추정 금지). 반감기 정직: raw ρ=headline(고유 실력); meta(변형 주입) ρ는 동급비교 불가 — 버킷팅 효과.
3. native 기준선
| 항목 | 값 | 근거 |
|---|---|---|
| 서열 | AGCKNFFWKTFTSC |
SST-14 참조 서열 |
| ddg 기준선 | -41.9864 kcal/mol (n=2) | [근거: [LOCAL_PATH]] |
| surrogate_halflife | 0.042 h | [근거: pyrosetta_flow/halflife_ensemble.py] |
| hc50 | 결측 (leaderboard 미등재) | — |
| selectivity Δmargin | 결측 (leaderboard 미등재) | — |
4. 측정 완비 상위표 (leaderboard, Δmargin 기준 정렬)
leaderboard 원본:
global_selectivity_leaderboard.json— 50건 전체 [데이터: [LOCAL_PATH]] 반감기 모듈:pyrosetta_flow.halflife_ensemble.ensemble_halflife[근거: pyrosetta_flow/halflife_ensemble.py] 열 신뢰등급: ddG·ΔΔG·Δmargin =실측HIGH(FlexPepDock 실측) · hc50·surrogate_halflife =surrogate-상대MED(절대값 미검증, native 대비 상대순위 전용). surrogate_halflife는 raw(고유 실력)이며 meta(변형 버킷팅)와 동급 비교 금지. 정렬: Δmargin 내림차순. native(순위 0)는 leaderboard 미등재 → hc50/Δmargin 결측.
| 순위 | 서열 | ddG (kcal/mol) | ΔΔG vs native | Δmargin (선택성) | hc50(모델) | hc50_vs_native | 독성↑ | surrogate_halflife (h) | 신뢰등급 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0(기준선) | AGCKNFFWKTFTSC |
-41.99 | 0.0 | — | 결측 | 결측 | — | 0.042 | 실측HIGH(ddg) |
| 1 | AGCKNFFWKTDTSC |
-45.11 | -3.12 | 10.5351 | -44.93 | 10.75 | 비독성 | 0.050 | 실측HIGH |
| 2 | AGCKYKFWKTFTSC |
-34.58 | 7.41 | 9.4809 | -50.48 | 5.20 | 비독성 | 0.034 | 실측HIGH |
| 3 | AICLNWFWKTVISC |
-48.81 | -6.83 | 9.3192 | -50.82 | 4.86 | 비독성 | 0.061 | 실측HIGH |
| 4 | ARCGKFFWKTATSC |
-32.12 | 9.87 | 9.1021 | -46.33 | 9.36 | 비독성 | 0.037 | 실측HIGH |
| 5 | AGCKNFFWKTETSC |
-39.52 | 2.47 | 8.9725 | -45.93 | 9.75 | 비독성 | 0.050 | 실측HIGH |
| 6 | AECMNFFWKTFTSC |
-31.53 | 10.46 | 8.6866 | -52.52 | 3.16 | 비독성 | 0.054 | 실측HIGH |
| 7 | EPCEVWFWKTYTSC |
-31.69 | 10.29 | 8.5552 | -60.13 | -4.45 | 비독성 | 0.063 | 실측HIGH |
| 8 | AGCKNRFWKTLTSC |
-32.78 | 9.21 | 8.4147 | -44.63 | 11.06 | 비독성 | 0.042 | 실측HIGH |
| 9 | AGCDNFFWKTFASC |
-32.11 | 9.88 | 7.7502 | -45.65 | 10.04 | 비독성 | 0.054 | 실측HIGH |
| 10 | AGCKVFFWKTPTSC |
-34.80 | 7.19 | 7.6029 | -43.40 | 12.28 | 비독성 | 0.050 | 실측HIGH |
| 11 | AGCKNQFWKTITSC |
-34.58 | 7.40 | 7.0626 | -42.61 | 13.07 | 비독성 | 0.057 | 실측HIGH |
| 12 | AGCERMFWKTVDSC |
-37.23 | 4.76 | 6.5434 | -44.52 | 11.16 | 비독성 | 0.056 | 실측HIGH |
| 13 | AGCKNHFWKTHESC |
-33.81 | 8.17 | 6.4364 | -47.84 | 7.84 | 비독성 | 0.055 | 실측HIGH |
| 14 | AGCTNFFWKTYTSC |
-44.14 | -2.16 | 6.1577 | -47.49 | 8.19 | 비독성 | 0.054 | 실측HIGH |
| 15 | AGCWNFFWKTFTSC |
-45.82 | -3.84 | 6.0961 | -54.23 | 1.45 | 비독성 | 0.048 | 실측HIGH |
| 16 | AGCKWFFWKTFTSC |
-42.58 | -0.60 | 5.9458 | -55.15 | 0.54 | 비독성 | 0.038 | 실측HIGH |
| 17 | AGCKNEFWKTSTSC |
-37.09 | 4.90 | 5.6905 | -40.97 | 14.71 | 비독성 | 0.057 | 실측HIGH |
| 18 | AGCENFFWKTMDSC |
-31.96 | 10.03 | 5.6136 | -45.75 | 9.93 | 비독성 | 0.064 | 실측HIGH |
| 19 | AMCKNFFWKTGTSC |
-40.04 | 1.95 | 5.6051 | -45.29 | 10.39 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 20 | AGCKNFFWKTIASC |
-42.69 | -0.70 | 5.5515 | -43.16 | 12.52 | 비독성 | 0.048 | 실측HIGH |
| 21 | AVCMNFFWKTFTSC |
-39.97 | 2.01 | 5.4932 | -50.30 | 5.38 | 비독성 | 0.054 | 실측HIGH |
| 22 | ADCDTAFWKTYASC |
-31.94 | 10.05 | 5.4274 | -43.90 | 11.78 | 비독성 | 0.062 | 실측HIGH |
| 23 | AGCKFFFWKTTTSC |
-38.32 | 3.67 | 5.0297 | -47.22 | 8.46 | 비독성 | 0.042 | 실측HIGH |
| 24 | AGCKWFFWKTPTSC |
-33.61 | 8.37 | 4.2518 | -50.59 | 5.09 | 비독성 | 0.045 | 실측HIGH |
| 25 | AGCKYRFWKTLTSC |
-38.72 | 3.27 | 4.1497 | -48.82 | 6.86 | 비독성 | 0.037 | 실측HIGH |
| 26 | AGCINFFWKTNASC |
-37.53 | 4.46 | 4.1330 | -42.21 | 13.48 | 비독성 | 0.062 | 실측HIGH |
| 27 | AGCKTFFWKTSVSC |
-36.08 | 5.91 | 4.1084 | -42.37 | 13.31 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 28 | AGCLWFFWKTFTSC |
-33.33 | 8.66 | 4.0400 | -54.10 | 1.58 | 비독성 | 0.046 | 실측HIGH |
| 29 | AGCKYDFWKTITSC |
-32.90 | 9.09 | 3.9263 | -45.83 | 9.85 | 비독성 | 0.050 | 실측HIGH |
| 30 | AGCKNFFWKTINSC |
-53.80 | -11.81 | 3.8022 | -45.82 | 9.86 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 31 | SYCNNNFWKTAVSC |
-34.56 | 7.43 | 3.8009 | -47.77 | 7.92 | 비독성 | 0.065 | 실측HIGH |
| 32 | AGCKWFFWKTMTSC |
-37.48 | 4.51 | 3.7270 | -51.35 | 4.34 | 비독성 | 0.044 | 실측HIGH |
| 33 | AGCKFFFWKTIASC |
-37.23 | 4.76 | 3.6346 | -46.34 | 9.34 | 비독성 | 0.042 | 실측HIGH |
| 34 | QWCKFQFWKTTISC |
-32.13 | 9.86 | 3.5685 | -62.56 | -6.88 | 독성↑ | 0.046 | 실측HIGH |
| 35 | AGCKNFFWKTSTSC |
-38.24 | 3.74 | 3.3674 | -43.20 | 12.48 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 36 | FNCPMFFWKTLSSC |
-35.39 | 6.60 | 3.1346 | -54.10 | 1.58 | 비독성 | 0.044 | 실측HIGH |
| 37 | AGCKYNFWKTITSC |
-46.22 | -4.24 | 3.0065 | -45.85 | 9.83 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 38 | AGCGTFFWKTALSC |
-46.89 | -4.91 | 2.9318 | -38.54 | 17.14 | 비독성 | 0.060 | 실측HIGH |
| 39 | KWCNPFFWKTSISC |
-36.38 | 5.61 | 2.8868 | -58.73 | -3.05 | 비독성 | 0.033 | 실측HIGH |
| 40 | AGCYNFFWKTAASC |
-36.24 | 5.75 | 2.7486 | -43.75 | 11.94 | 비독성 | 0.053 | 실측HIGH |
| 41 | EGCKNFFWKTLTSC |
-41.82 | 0.17 | 2.6885 | -49.63 | 6.05 | 비독성 | 0.052 | 실측HIGH |
| 42 | MGCIQPFWKTIPSC |
-34.32 | 7.66 | 2.6486 | -44.52 | 11.16 | 비독성 | 0.080 | 실측HIGH |
| 43 | AGCKYFFWKTITSC |
-35.99 | 6.00 | 2.5298 | -49.07 | 6.61 | 비독성 | 0.042 | 실측HIGH |
| 44 | QMCYPFFWKTIFSC |
-32.05 | 9.94 | 2.1647 | -61.33 | -5.64 | 독성↑ | 0.055 | 실측HIGH |
| 45 | AGCKYDFWKTATSC |
-37.83 | 4.15 | 2.1585 | -43.21 | 12.47 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 46 | AGCKLFFWKTLASC |
-43.74 | -1.75 | 2.1377 | -43.22 | 12.47 | 비독성 | 0.045 | 실측HIGH |
| 47 | AGCKWDFWKTITSC |
-40.13 | 1.85 | 2.0812 | -48.02 | 7.66 | 비독성 | 0.050 | 실측HIGH |
| 48 | AGCKWFFWKTATSC |
-39.77 | 2.22 | 1.9210 | -48.51 | 7.17 | 비독성 | 0.043 | 실측HIGH |
| 49 | AGCKNFFWKTMTSC |
-42.53 | -0.55 | 1.8008 | -44.95 | 10.73 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
| 50 | AGCKFDFWKTITSC |
-39.32 | 2.66 | 1.7589 | -44.93 | 10.76 | 비독성 | 0.049 | 실측HIGH |
5. 데이터 근거 및 한계
5.1 소스 파일
| 파일 | 경로 | 건수 |
|---|---|---|
| experiment_log.jsonl | [LOCAL_PATH] |
20,733건 |
| global_selectivity_leaderboard.json | [LOCAL_PATH] |
50건 (entries) |
| halflife_ensemble | pyrosetta_flow/halflife_ensemble.py |
계산 모듈 |
5.2 신뢰등급 정의
- 실측HIGH: FlexPepDock PyRosetta 실행 산물(ddg, delta_margin). 재현 가능.
- surrogate-상대MED: pepADMET hc50 또는 반감기 휴리스틱. 상대 순위 신뢰; 절대값 미검증.
- 절대LOW: 절대 수치로 환산 불가한 지표 — 본 표에 없음.
5.3 한계 및 결측 처리
- experiment_log 20,733건에는 halflife/hc50 미포함 → 결측 표기(추정 금지).
- hc50은 pepADMET 모델 회귀 출력 — 절대 단위 미검증, native 대비 상대 비교 전용 [근거: pyrosetta_flow/pepadmet_toxicity.py:25-29].
- 반감기 raw ρ = headline(고유 실력); meta(변형 메타데이터 주입) ρ는 동급비교 불가 — 버킷팅 효과 [근거: _workspace 메모리 반감기 raw vs meta 합의].
- native는 leaderboard 미등재 → selectivity/hc50 결측.
5.4 재현 스크립트
[LOCAL_PATH] \
[LOCAL_PATH]
산출 파일:
- SIM_results.csv — 완비 지표 테이블 (51행)
- SIM_results.json — 동일 내용 + 전체 통계
- 08_sim_results.md — 본 보고 페이지